1948年，中国人民解放军相继取得辽沈、淮海、平津三大战役的伟大胜利，国民党反动统治已面临全面崩溃的绝境。为争取解放战争在全国的最后胜利，中国人民解放军执行党中央“将革命进行到底”的指示，开始了战略大反攻。为迎接解放大军南下，中共闽浙赣省委于1948年12月发出《关于配合解放军解放闽浙赣，开展武装斗争紧急任务的决定》和《关于争取闽浙赣人民解放与我们紧急任务的指示》，要求各地发展壮大党的组织，扩大地区游击武装，发动群众配合解放大军解放闽浙赣地区。
由于阮英平牺牲和城工部事件的影响，闽东党组织及其领导的武装力量受到严重损失，闽东游击大队人员全部撤往南古瓯地区。为了迎接和配合解放军南下，1949年初，在南平桃坪左丰美代表中共闽浙赣省委，指派中共闽东地委委员陈邦兴返回闽东，恢复发展党组织和开展游击战争。陈邦兴从南平赶到建瓯，向刘捷生和黄垂明传达了省委指示。3月，陈邦兴率领30多人的武装队伍从南平到宁德县山区活动，向人民群众宣传革命形势，发动群众抗丁抗粮。6月，根据中共闽浙赣省委的指示，中共闽东工作委员会成立，书记陈邦兴。
在此前后，闽东各地因城工部事件而失散的城工部党员也集合起来，恢复建立党的组织。
1949年初，城工部宁德工委在宁德、周宁两县领导发动群众，建立武装，形势发展很快。为了适应斗争发展的需要，宁德工委决定分别在宁德、周宁召开会议，研究部署新的战斗任务。2月，孙子清在咸村小学主持召开了周宁县党的骨干会议。会议在听取各基层组织的汇报后做出决定：一方面继续派人寻找上级党组织，同时联络留在当地和山头的老游击队员；另一方面根据斗争的需要，成立周宁县工委，书记孙式康，副书记汤洪潮，以加强对周宁开展武装斗争和统战工作的领导，立即在周宁、宁德边界地区恢复工作，重新建立根据地，作为迎接解放大军南下的基地。此时，周宁城工部党员有46人，划分为咸村、川中、玛坑、七步、际会等几块地区，分工开展斗争活动。不久，孙子清在霍童兴贤村主持召开会议，宣布成立城工部宁德县工委，书记章康瑞，副书记苏芝华，下辖城关、霍童2个党支部，赤溪、邑坂、三都3个党小组。会议还将宁德县划分为赤溪、霍童、三都和城关4个工作片区。同时，城工部宁德工委从各个游击小组中抽调18名骨干组成宁周游击队，孙子清任队长。
2月，城工部宁德工委在周宁后垄洋尾村成立了城工部屏南县工委，书记周岩冰，副书记陆吉姿。城工部屏南县工委成立后随即召开会议，决定将原来分散活动的武装游击小组组建为闽屏人民游击队。会议还将屏南县划为寿山、双溪、棠口（包括巴溪、古厦、长坋）、漈下（包括长桥）、前塘（包括熙岭、忠洋）、漈头、岭下等7个工作片区，由周岩冰、陆吉姿等分别负责寿山、岭下等工作片区。明确其任务是：发展党员，筹建区工委；发动群众成立贫农团等革命组织；为游击队选送队员，扩大武装队伍；建立交通联络总站，由周家佐任站长并负责在各活动片区设立交通分站，配备党员负责。屏南县工委成立后，在屏南、周宁及宁德边区一带，宣传党的政策，组织群众开展抗丁、抗税、抗粮、抗租斗争。在斗争中，城工部屏南县各级组织和人民游击队迅速发展壮大。3月，周政屏县委负责人何道武在周宁后垅村组建闽东山头游击队（也称周政屏山头游击队）。游击队在屏南寿山乡、康里乡开展工作，宣传全国解放战争的大好形势和党的政策，以政治攻势配合武装行动；发动群众，在边界地区开展护粮斗争，以反对与抵抗国民党的征兵、征粮、征税的“三征”活动。同时还在寿山、降龙等村开展收缴地主枪支和向地主借粮等活动。同月，闽屏人民游击队在周宁后垅村宣布正式成立，队长陆吉姿，政委周岩冰。闽屏人民游击队以后垅一带为根据地，活动于宁德、周宁、屏南和福安穆阳等地，逐步向屏南纵深发展。4月，岭下、棠口、寿山、前塘、漈下五个工作片区先后成立了区工委，各区成立了贫农团，并先后建立了岭下、棠口、寿山、前塘4个党支部和漈下、漈头、双溪3个党小组，党员发展到70多人，同时向游击队选送了100多名游击队员。
1949年2月，城工部霞浦工委在江边竹下寺召开扩大会议，决定建立游击山头，开展武装斗争；派人到浙南继续寻找党的上级组织关系。会后，霞浦工委经过勘察选择，决定将游击山头建立在柘荣桃坑的南广山。同月，林登弟等8人携8支短枪上山建立了霞（浦）（福）安柘（荣）边区游击队。随后，又有30多人陆续上山，游击队不断扩大，不久扩编为霞浦人民游击队，队长林登弟，政委陈侃。城工部霞浦工委随即决定由林登弟等人负责领导武装斗争，并在斗争中建立和发展党的基层组织。至4月，城工部霞浦工委下辖有南山、东乡、松山等7个党的区工委组织，有党员160多人。
1949年5月初，国民党当局解散了福安师范、高等农校两所学校，福安师范党支部解体。根据原福安师范党支部领导人吴殿寻的指示，詹其适在穆阳主持建立了穆阳临时党支部，詹其适任书记，有30位党员，并确定党支部的主要工作任务是发展党员，壮大组织；领导发动群众继续开展“三反四抗”（反饥饿、反内战、反迫害和抗丁、抗粮、抗捐、抗税）斗争；收集敌情，筹建游击队，开展武装斗争。随即，穆阳临时党支部将全县分成7个工作片区，对党员和任务作了分工。同时，为了便于联系，临时党支部还在穆阳、洪口、赛岐、山溪设立了4个联络站。
为配合南下大军解放闽东，1949年3月，陈邦兴率部到达宁德后成立了闽浙赣游击纵队第四支队，支队长陈邦兴。4月，宁周游击队在周宁苦爹岗整编为闽浙赣游击纵队第五支队，支队长孙子清，副支队长汤洪潮，政委孙式康。5月，屏古瓯游击支队与古田人民游击队在古田凤都桃花溪村会合，整编为闽浙赣游击纵队古田支队，下辖3个大队，拥有700余人、400多支枪，支队长郑荣堂，政委叶明根。6月底，闽东工委将闽浙赣游击纵队第四、第五支队和闽古林罗连中心县委游击大队一部及古闽林工委游击队第四中队等武装合编为闽东人民游击队，由陈邦兴、黄垂明领导，下辖3个大队9个连，共1100余人。
这一时期，闽东各地组建的游击武装还有：1949年4月，福鼎县委警卫队、鼎平县委警卫队先后成立，队长分别为林乃珍和洪永江（8月，福鼎、鼎平县委警卫队合编为福鼎县大队）；5月，城工部古闽林武工队奉闽古林罗连中心县委的命令，抽调80余人抵达罗源霍口，集训后编入闽古林罗连游击大队第四中队，中队长魏宜芝，指导员黄宗意，下辖3个分队；6月，闽浙赣人民游击队第二纵队第三支队在福安桥溪成立，支队长林友川，政委张炯，下辖两个分队和一个政工队，有队员130多人，长短枪150多支；6月，福安工作队在官洋成立，队长林秀明，下辖3个武装中队和1个政工队，拥有120余人枪，不久，被编入闽东人民游击队。
闽东各地积极恢复和发展壮大党组织，扩大游击武装，发动群众，为迎接南下大军解放闽东做了大量准备。